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CNET更新于 10月25日 20:41

Hugging Face 发布 Carbon-X 模型,可用自然语言与 DNA 序列对话

Hugging Face Announces AI Model to ‘Chat’ With DNA

AI 导读

Hugging Face 发布 Carbon 系列中最新且能力最强的模型 Carbon-X,研究人员可输入 DNA 序列并用自然语言提问,获得解读、预测或解释。研究人员 Lewis Tunstall 表示,该模型最擅长预测突变影响和补全 DNA 序列,例如判断某个序列变化是否可能有害,并可在本地硬件上运行敏感或未发表序列。Hugging Face 也指出该模型存在计数出错、在提示信息不足时编造序列身份或功能、以及长序列输出质量下降等限制,并公开了训练配方供社区检验。

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AI 评分 66

Carbon-X 把 DNA 序列接入自然语言问答,并公开训练配方,读者可据此判断生物研究中的本地部署与可审查性。

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一种新的人工智能模型能够将DNA与人类语言连接起来,使科学家能够以新的方式与遗传密码进行交互。Hugging Face于周四发布了Carbon-X模型,这是该公司Carbon系列中最新、最强大的模型,该系列是一组专为分析DNA而构建的人工智能模型。

“Carbon-X让研究人员首次能够‘与DNA对话’:他们可以提供一段序列,并用自然语言就它提问,”Hugging Face研究科学家Lewis Tunstall通过电子邮件告诉CNET。

“聊天”一词并不意味着与你的基因组交谈,而是把人工智能用作对话式界面,让用户粘贴一段DNA序列、用通俗英语提出问题,并收到返回的解读、预测或解释——就像用于DNA分析的聊天机器人。

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最受欢迎的聊天机器人,如ChatGPT、Gemini和Claude,都是基于云的模型,并不在你的电脑上运行。处理在远程进行,然后你把结果取回。但如果你正在从事尚未发表的机密或专有研究,你可能不想把它分享给一家人工智能公司。“研究人员需要能够研究、调整并在自己的硬件上运行敏感或未发表序列的模型,”Tunstall说。

像Carbon-X这样更小、更专业的人工智能模型的好处之一是,它可以在不使用他人计算机的情况下运行。Hugging Face表示,该模型还可以与其他人工智能代理协同工作。

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Carbon-X只是Hugging Face上可供下载的数千个人工智能模型之一,Hugging Face是一个用于构建和部署人工智能的开源中心和工具包,今年早些时候因臭名昭著的OpenAI黑客事件而登上全球头条。

DNA代理

需要明确的是,Carbon-X不是实验室机器,因此它无法对DNA进行物理测序。它可以查看DNA,例如文本文件中的DNA序列,而你可以就它提问。Tunstall说,Carbon-X最强的领域是该模型预测突变效应和补全DNA序列的能力。

“Carbon-X尤其擅长帮助研究人员研究遗传变异,例如预测DNA序列中的某个变化是否可能有害,”Tunstall说。

他还表示,当另一个AI模型需要提取信息时,它可以为其提供接触DNA专家的途径。

然而,根据该公司的博客文章,该模型确实存在局限性。Carbon-X可能因计数错误而搞乱测序操作,它也可能产生幻觉,这意味着该模型会凭空编造信息。Hugging Face指出,当用户在提示中没有提供足够信息时,该模型可能会编造序列的身份或功能。

据该公司称,当用户要求该模型生成特别长的DNA序列时,Carbon-X的输出质量也往往会下降。

快如闪电

9月,英伟达宣布将以略低于130亿美元的价格收购Hugging Face。当时,英伟达首席执行官黄仁勋称该公司是“开放模型开发者社区的活力家园”。开放模型是指其训练方式的某些方面公开可用的人工智能模型。

Carbon-X的发布仅数周前,OpenAI的模型开始解决长期存在的数学问题。这家人工智能实验室因其专有模型在未咨询科学家或展示解决问题所做工作的情况下解决了若干长期存在的问题,而遭到学术研究人员的广泛批评。

但Carbon-X是一个开放模型,因此精通人工智能的生物学家至少可以窥探该模型俗称的引擎盖之下,一瞥它的运行方式。

“我们认为研究人员也需要开放的替代方案,使他们能够独立审视其能力、局限性和风险,”Tunstall说。“通过公开释放Carbon-X及其训练配方,我们使更广泛的科学界能够测试它在哪些方面有效、找出它在哪些方面失败,并帮助改进它。”

Julian Dossett

撰稿人

Julian是CNET的撰稿人和前正式撰稿人。

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